Coordinación general (secretario Técnico): Es el órgano de dirección, encargado de ejecutar y hacer cumplir las normas, convenios, normas, etc. Su función básica es la de programar, organizar, dirigir, coordinar, supervisar y controlar las actividades de la gestión técnico-administrativa de conformidad a lo previsto en el plan estratégico del FAQ. La persona a cargo es el Ing. Abel Calle Cruz.

 Asesoría legal: Es él área encargada de atender asuntos de carácter jurídico-legal-administrativo y colaborar con la Secretaría técnica, asamblea general y consejo directivo del FAQ, en los aspectos que la requieran, como: Asesorar en aspectos de carácter jurídicos y legales; emitir opinión en los procesos administrativos y contencioso-administrativos que sean sometidos a su consideración; Actualmente cuenta con un abogado externo.

Administración – Contador: Es área de apoyo del FAQCH, a cargo elaboración de planillas, adecuada conducción de los sistemas administrativos de personal, abastecimiento, contabilidad, así como la administración tributaria y la ejecución presupuestal. Actualmente se cuenta con una persona externa.